Aula - 05

Tamanho e forma das proteínas

• Cada proteína tem um tamanho e uma forma bem característico
• O tamanho e a forma de duma proteína estão intimamente ligados à sua função
• Tamanho das proteínas geralmente é expresso em nanômetros (nm). Um nm é igual a 10^-9 metro 
• A massa molecular de uma proteína geralmente é expresso em Kilodaltons (KDa) 1KDa é igual a 10³ Daltons.

Características estruturais da ligação peptídica

• A ligação peptídica tem um caráter de ligação dupla 
• Não há rotação no eixo da ligação peptídica 
• Os átomos de O,C,N e H ocupam o mesmo plano 
• O e H assumem conformação trans 
• A ligação peptídica forma um dipolo

O Diagrama de Ramachandran

• Conformações onde não há impedimento espacial
• Conformações onde há pequeno impedimento espacial, possíveis com alguma tensão
• Conformações impossíveis
• Localização das folhas beta e das hélices alfa no diagrama de Ramachandran

A Hélice alfa

• Papel das pontes de hidrogênio intradadeia sua estabilização
• Localização das cadeias laterais
• As propriedades elétricas da hélice alfa
  
  
  
  
  Hélice Alfa
  
  
  Estrutura secundária - Hélice alfa
  
  
  
  
• Folhas beta

• Paralela
• Antiparalela
• As pontes de H entre os O e os H das ligações pépticas estabilizam a estrutura 
• A os grupos R se localizam fora do plano da folha para cima e para baixo alternadamente 
• A folha apresenta um pregueamento de ~7A (0,7nm)
   
  
  Folha Beta

 

Estrutura secundária - Folha beta


 

Voltas beta

Estrutura do cabelo

• O cabelo é formado pela proteína queratina 
• 100% hélice a
• Hierarquia estrutural da queratina

Estrutura do Colágeno

• Estrutura primária repetitiva
• Alto teor de glicina e hidroxiprolina 
• Superhélice de colágeno
• Localização dos resíduos de glicina
• Estrutura das fibrilas de colágeno
  
  
  
  
  
  Estrutura da fibroína
  
  
  
  
  
  
  
  • Proteína das teias
  • Presença predominante de folhas beta
  • Altos teores de alanina e glicina
  • Alta resistência mecânica

  Formas de representar a estrutura de uma proteína

  
  

  

  
  

  
  

  
  

  • Representação de superfície
  • Representação em fita
  • Representação em fita incluindo cadeias laterais
  • Modelo de preenchimento espacial
    
    
    
    
    

    • Grupamentos prostéticos
    
    

    • 
      
    
    

    •  O heme
    
    
    
    
    
    
    
    Domínios estruturais
    
    

    
    

    

    
    

    
    

    
    

    
    

    Motivos estruturais

    
    
    

    

    
    

    
    

    Padrões de dobramento estáveis em proteínas

    
    

    

    
    

    
    

    Capsídeos Virais

    
    

    
    

    

    
    

    
    

  Desnaturação de proteínas

  
  

  

  
  

  
  

  
  

  Enovelamento de proteínas

  
  

  

  
  

  Chaperonas

  
  

  

  
  

  
  

  Agregados amiloides

  
  

  
  

  

  
  
  
  
  

  Veja mais vídeos:

  
  

  Coiled Coil

  
  

  Estrutura secundária: coiled coil

  
  

  
  

  
  

  Ponte Dissulfeto

   

  
  

  
  

  
  

  Proteínas Oligomericas

   

  
   Muitas proteínas são compostas de várias cadeias polipeptídicas, ou subunidades.Este vídeo descreve a estrutura de alguns exemplos dessas proteínas oligoméricas.
  
  
   Imunoglobulina G
  

   

  
   Esse vídeo mostra a estrutura de uma imunoglobulina do tipo G (IgG) e sua ligação ao antígeno.

  
  

  
  

  
  

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   Apostila                     Exercício
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